1、穴盤孔徑大小。育苗盤因穴孔直徑大小不同，穴孔數有18-800不等。育中、小型種苗，以128-288孔的穴盤較為經濟；秋海棠、鳳仙等盆栽花卉育苗，應選擇穴孔直徑較大的穴盤；而深根性的飛燕草和部分蔬菜作物，則宜選擇穴孔較深的穴盤。非洲菊、仙客來等可先在小穴孔育苗盤中發芽，再移栽到大穴孔育苗盤育中壯苗。 

    2、穴孔的形狀。穴孔形狀主要有方形和圓形，方形穴孔所含基質一般要比圓形穴孔多百分之三十左右，水分分布也較均勻，小苗根系發育更加充分。 

    3、穴盤的制造材料。主要有聚苯乙烯聚苯泡膜，觀賞植物育苗一般用聚苯乙烯盤，蔬菜育苗可用聚苯泡膜盤。 

    4、穴盤的顏色。穴盤的顏色會影響到育苗根部的溫度，白色的聚苯泡膜盤反光性較好，多用于夏季和秋季提早育苗，以利反射光線，減少小苗根部熱量積聚。而冬季和春季選擇黑色育苗盤，因其吸光性好，對小苗根系發育有利。